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hCov-HKU1-E Pseudovirus Standard Reference

CBV30016

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I. 背景

hCov-HKU12005年在香港發(fā)現(xiàn),是上呼吸道和下呼吸道自限性感染的常見原因,最常見于幼兒。沒有實驗室診斷,通常通過呼吸道樣品的逆轉錄聚合酶鏈反應(RT-PCR),HCoV-HKU1呼吸道感染無法與其他呼吸道病毒引起的感染區(qū)分開。治療應具有癥狀且符合支持病毒性呼吸道感染的一般指南。

根據(jù)CDCWHO的介紹,針對 hCov-HKU1的核酸診斷一般是針對RdRP (RNA-dependent RNA polymerase)、Gene NGene E, Gene S更多用于對應藥物和疫苗的開發(fā)。NCBI收錄序列為KF686346,全長29982,基因編碼5個結構蛋白:SM,N,HEE

以往針對試劑盒檢測限的性能評價,一般是選擇體外轉錄的RNA、或者臨床陽性病毒來作為標準品,用于性能評價。但是兩者都具有很明顯的確定,首先體外轉錄的RNA,一般是很純,單一,不涉及提取,不符合臨床病毒的微環(huán)境,因此必然造成檢測靈敏度被高估,這也是存在高概率假陰性的主要原因;再次臨床陽性病毒,即使是滅活的病毒,也是存在很大的生物安全隱患,因此要求實驗室級別為P3-P4,大部分開發(fā)診斷試劑盒單位都不滿足改要求,另外臨床陽性病毒也是來源很有限,不能被穩(wěn)定供應,反復用于試劑盒的性能評價。

 
II.產品描述

有病毒的完整包膜結構,有HCoV-HKU1對應的核酸序列,但是生物安全風險較低的假病毒標準品,完美的克服了選擇體外轉錄的RNA、或者臨床陽性病毒來作為標準品的缺點,非常適合用于核酸診斷性能評價的標準品。

構建過程:HCoV-HKU1基因合成→假病毒包裝→純化→QC檢測(ddPCR)

 
III. 產品介紹
產品名稱: hCov-HKU1-E Pseudovirus Standard Reference
對應序列(詳情見附錄):

Gene E(249bp)

產品規(guī)格: 1ml
拷貝數(shù): >1x10e7copies/ml
生物安全級別: P2
運輸與保存方式: 干冰運輸,-90 ~ -70°C保存
 
IV. 產品用途與優(yōu)勢
產品用途: HCoV-HKU1診斷試劑盒性能評價
產品優(yōu)勢: • HCoV-HKU1的假病毒標準品,區(qū)別于以往體外合成的RNA、臨床陽性活病毒,完美克服兩者的缺點,真正適合用于試劑盒的性能評價,包含檢測限、特異性,重復性等;

• 根據(jù)HCoV-HKU1冠狀病毒的特點,選取了ORF1ab/RdRP(RNA-dependent RNA polymerase)、Gene E(envelope protein)、Gene N(nucleocapsid phosphoprotein)合計3個區(qū)段的序列,用于假病毒的包裝,3個區(qū)段很好的表征了HCoV-HKU1的特征序列;

• 科佰生物設計了ddPCR體系的引物、探針序列,可不需要構建標準曲線的前提下完成對假病毒的QC拷貝數(shù)檢測,非常準確表征標準品的拷貝數(shù),而且克服了Q-PCR分析CT值的相對判斷標準的不準確性;

• 假病毒標準品,無致病性,可再生,質控方法可靠,批次間穩(wěn)定,可以長期穩(wěn)定制備和供應,而且要求實驗室生物安全級別為P2,滿足很多單位的安全需求。

 
Ⅴ. 附錄

Gene E:

ATGGTTGATTTATTTTTCAATGATACTGCTTGGTACATAGGACAGATTTTAGTTTTAGTTTTATTTTGTCTTATTTCTTTAATCTTTGTTGTTGCTTTTTTAGCAACTATTAAGCT

TTGTATGCAACTTTGTGGTTTTTGTAATTTCTTTATTATTTCACCTTCGGCTTACGTTTATAAAAGAGGTATGCAGTTGTATAAGTCTTATAGTGAACAAGTTATACCACCCACTT

CAGATTATTTAATCTAA

 

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